Cultures &Compétences Numerique

Ce cours est conçu pour aider les étudiants à l'exploration et la connaissance de soi pour atteindre la réussite.   La pensée critique sera utilisée pour aider les étudiants dans leur développement de soi.  Les étudiants examinent les valeurs, les habitudes, les attitudes et les comportements qui les aideront à maximiser leurs capacités à réussir dans la vie et atteindre leur potentiel maximum. 


Biologie Moleculaire

La Biologie moléculaire est une science fondamentale de base dont l'objet est la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule au niveau macromoléculaire, c'est à dire au niveau des acides nucléiques. Grâce aux divers outils moléculaires (les polymérases, les nucléotides, les nucléases, enzymes de restriction, phosphatases, ligases, transférases, kinases, amorces, sondes, …) dégagés par ses connaissances théoriques, la biologie moléculaire est, en association  avec d'autres sciences (chimie, biochimie, sciences biologiques animales, végétales et microbiennes), à l'origine des biotechnologies moléculaires actuelles à aspect fondamental ou appliqué, allant de la technologie de l'ADN recombinant (clonage et isolement des gènes, production de protéines recombinantes dans des systèmes d'expression hétérologue, conception des OGM) jusqu'aux techniques d'étude de la génomique structurale (séquençage, annotation et comparaison des génomes) et fonctionnelle (mutagénèse ciblée et aléatoire, gene silencing via l'interférence aux ARN), de la transcriptomique (techniques de blotting, puces à ADN, fusions transcriptionnelles et traductionnelles), de la protéomique ainsi que celles de l'étude de la diversité génétique entre individus (analyse du polymorphisme moléculaire, cartographie physique, typage moléculaire) et de l'amélioration génétique des espèces …etc pour ne citer que quelques uns des aboutissements de cette science.

Le cours de Biologie moléculaire englobe tous les processus responsables de la "dynamique" des acides nucléiques et les mécanismes moléculaires de leur contrôle. Il consiste à étudier la réplication de l'ADN, la structure des gènes, leur expression et leur régulation aux niveaux transcriptionnel et traductionnel. Ces mécanismes impliquent l'interaction des acides nucléiques avec divers complexes protéiques, enzymatiques ou autres, dont on n'abordera que certains d'entre eux. Chaque leçon est clôturée par une partie pratique reposant sur des applications/expériences utilisant les outils moléculaires découlant des connaissances théoriques relatives au cours en question. Des TD corrigés de Biologie moléculaires sont également proposés.

Teacher: sinda fedhila

Genomique fonctionnelle et Regulation de l'expression génétique

Dans le premier ECUE "Régulation de l'expression génétique", nous présentons certains exemples de régulation de l'expression génétique chez les procaryotes (opérons lactose, arabinose et tryptophane), les virus (gènes contrôlant le cycle biologique des phages T4 et lambda et du virus SV40) et les eucaryotes où il est question de traiter la régulation de l'expression des gènes au niveau transcriptionnel (interactions séquences cis-régulatrices/facteurs trans-régulateurs, sans doute le niveau de contrôle le plus important), post-transcriptionnel (épissage des transcrits, éditing, modification voire dégradation des ARNm par les petits ARN), traductionnel et post-traductionnel faisant intervenir les événements de phospohrylation et d'Ubiquination. Un chapitre consacré à la régulation de l'expression génétique au niveau de la chromatine (remodelage de la chromatine et modification des histones) est également évoqué. Enfin, nous exposons quelques techniques d'étude de l'expression génétique aussi bien au niveau transcriptionnel que traductionnel (conception de fusions plasmidique ou chromosomiques avec des gènes rapporteurs, transferts Northern et Western, comparaison de transcriptomes par électrophorèse bidimensionnelle, mise en évidence de la fixation d'une protéine sur un ADN par "DNA mobility shift assay" et identification de la séquence régulatrice par footprinting…).

Le deuxième ECUE "Génomique structurale et fonctionnelle" s'articule autour de deux grands chapitres : la génomique structurale et la génomique fonctionnelle. La génomique structurale s'intéresse à définir la structure des séquences d'ADN fonctionnel et non fonctionnel, à leur nature et aux principes selon lesquels elles sont organisées au sein des génomes. En outre, ce chapitre comporte tout un volet traitant des marqueurs moléculaires et leur utilisation dans l'assemblage des cartes physique. La métagénomique qui est une méthode relativement récente de séquençage et d'étude du contenu génétique d'organismes non cultivables est également abordée. Par opposition à la génomique structurale, la génomique fonctionnelle s'intéresse à définir la fonction de tous les gènes d'un génome, et inversement, identifier les gènes du génome responsables d'une fonction bien déterminée. Elle repose, pour cela, sur diverses approches dont nous examinons (i) celle dite comparative fondées sur l'inactivation génique soit par mutagénèse in vivo ciblées ou bien par "gene silencing" via les ARN interférents ; (ii) l'approche aléatoire par mutagenèse insertionnelle de transposons ; (iii) les approches de transcriptomique fondées sur les systèmes de piégeage de promoteurs à activité transitoire et sur l'analyse de l'expression différentielle des gènes. Sont également traitées les méthodes permettant de déterminer la localisation subcellulaire des produits des gènes et leur éventuelle interaction avec des molécules cibles. Ces dernières fournissent des détails supplémentaires quant à la fonction du gène en question"

Teacher: sinda fedhila

Cours TIC & Multimédia

Cours TIC & Multimédia 

2ème année BT  et PE à l'ISSBAT

Teacher: hayfa khayat